副教授

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卢诚谦

作者:日期:2023-10-10 21:00浏览数:

        职      称:副教授

        部      门:软件工程系

        研究领域:人工智能、生物信息学、RNA语言、结构和功能挖掘

        邮      箱:chengqlu@xtu.edu.cn

        电      话:15111159185                                       办 公 室:信息科技大楼423

 

卢诚谦,博士,硕士生导师,现为湘潭大学计算机学院副教授。2019年博士毕业于中南大学计算机科学与技术专业,2022年中南大学博士后出站。主要从事机器学习、深度学习、图神经网络、生物信息学等方面的研究。目前主持国家自然科学基金青年项目1项、湖南省教育厅优秀青年项目1项、湘潭大学博士科研启动资助项目1项,作为骨干成员参与国家重点研发等国家级研究课题5项。2023年荣获教育部高等学校科学研究优秀成果2奖。已在国际学术权威期刊Advanced Science、TNNLS、Bioinformatics、Pattern Recognition、Briefings in Bioinformatics、Journal of Biomedical Health Informatics、IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB)、Methods等发表学术论文10余篇,2篇论文入选ESI全球高被引论文。担任IJCAI、TNNLS、Bioinformatics、Pattern Recognition、Briefings in Bioinformatics、J-BHI、TCBB、BIBM和APBC等国际期刊和会议的审稿人。


     招生说明:

本人主要从事机器学习、深度学习、图神经网络、生物信息学等方面的研究,解决RNA语言、RNA结构和功能挖掘,药物靶标及药物设计,脑肿瘤分割等相关问题。

长期招收本校计算机、数学、电子相关专业的本科生进组实习,请将个人简历和成绩单发送到chengqlu@xtu.edu.cn。

希望申请的学生具备以下素养:1)上进心和热情;2)具备一定的英语以及数学基础;3)熟练掌握至少一门编程语言。

 

工作经历

2022 - 至 今,   湘潭大学计算机学院·网络空间安全学院

2020 - 2022,   中南大学, 博士后

研究领域

1.人工智能

2.生物信息学
3.
机器学习
4.
图神经网络
5.
医学影像

代表作

      1. Chengqian Lu, Tao Peng, Xiangmao Meng, Min Zeng, Yi Pan, Jianxin Wang. Multi-scale cross-attention integrates dynamic and static features for proteinRNA prediction. Pattern Recognition. (一作,SCI一区,中科院一区,Top期刊,影响因子:7.6)
     2. Wen Tian, Min Zeng, Jianxin Wang, Chengqian Lu*. MotifGT-DTI: Pivotal Motif-Based Graph Transformer Model Improves Drug-Target Interaction Prediction. IEEE Transactions on Neural Networks And Learning Systems. (唯一通讯,SCI一区,中科院一区,Top期刊,影响因子:8.9)

     3. Lishen Zhang, Chengqian Lu, Xiaoqing Peng, Fei Guo, Hongdong Li, and Jianxin Wang. diPaRIS: Dynamic and Interpretable Protein-RNA Interactions Prediction With U-Shaped Network and Novel Structure Encoding. Advanced Science. (二作,SCI一区,中科院一区,Top期刊,影响因子:14.1)

     4. Chengqian Lu, Mengyun Yang, Feng Luo, Fang-Xiang Wu, Min Li, Yi Pan, Yaohang Li, Jianxin Wang. "Prediction of lncRNA-disease associations based on inductive matrix completion". Bioinformatics, 2018, 34(19):3357-3364. (CCF A,IF: 5.4, ESI 1%)

     5. Chengqian Lu, Min Zeng, Fang-Xiang Wu, Min Li, Jianxin Wang. "Improving circRNA-disease association prediction by sequence and ontology representations with convolutional and recurrent neural networks". Bioinformatics, 2020, 36(24):5656-5664. (CCF A, IF: 5.4)

     6. Chengqian Lu, Lishen Zhang, Min Zeng, Wei Lan, Guihua Duan, Jianxin Wang. "Inferring disease-associated circRNAs based on edge-weighted graph attention and heterogeneous graph neural network". Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1):bbac549. (IF: 7.7, 中科院1区, Top期刊)

     7. Chengqian Lu, Mengyun Yang, Min Li, Yaohang Li, Fang-Xiang Wu, Jianxin Wang. "Predicting lncRNA-disease associations based on geometric matrix completion". IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2019, 24(8):2420-2429. (IF: 6.7, 中科院1区, Top期刊)

     8. Chengqian Lu, Min Zeng, Fuhao Zhang, Fang-Xiang Wu, Min Li, Jianxin Wang. "Deep matrix factorization improves prediction of human circRNA-disease associations". IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2020, 25(3):891-899. (IF: 6.7, 中科院1区, Top期刊)

     9. Lishen Zhang*, Chengqian Lu*, Min Zeng, Yaohang Li, Jianxin Wang. "CRMSS: Predicting circRNA-RBP binding sites based on multi-scale characterizing sequence and structural features". Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1):bbac530. (IF: 7.7, 中科院1区, Top期刊)


科研项目

1. 基于潜在因子模型的环状RNA与疾病相关性研究,国家自然科学基金2021-01-012023-12-31主持

2. 基于多源图神经网络的环状RNA与复杂疾病关联预测研究,湖南省教育厅优秀青年项目 2022-09-012024-12-31主持

3. 基于超算与多组学的智能医药大数据关键技术研究及应用,国家自然科学基金,2023-01-012026-12-31,参与;

4. 基于网络测绘的工业互联网系统拓扑结构识别与优化,国家自然科学基金,2023-01-012025-12-31,参与;

5. 基于稀疏矩阵填充的生物实体关联预测方法,国家自然科学基金,2020-01-012023-12-31,参与;

6. 基于异质属性网络表征学习的识别癌症驱动基因算法研究,国家自然科学基金,2020-01-012023-12-31,参与;

发明专利

1. 卢诚谦,田雯,林轩,孟祥茂。基于多视角特征融合的药物-靶标相互作用预测方法、设备和介质

2. 卢诚谦,黄睿,颜淳羲,刘逸涵,刘宇鑫。基于多模态的聋哑人手语识别方法、装置、设备和介质

3. 卢诚谦,王建新,段桂华,张立身,曾敏,兰伟。基于带权图注意力和异构图神经网络的环状RNA-疾病关联预测方法、设备和介质

主讲课程

1.多媒体基础
2.
自然语言处理

3.云计算

社会兼职

1. 中国计算机协会CCF会员,计算生物学与生物信息学专业委员会委员

2. 国际权威会议International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI)、 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)Asia Pacific Bioinformatics Conference程序委员会委员 (PC Member)

3. 国际学术权威期刊Advanced Science、TNNLS、BioinformaticsPattern Recognition、Briefings in BioinformaticsJournal of Biomedical Health Informatics, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics(TCBB), Method等期刊,审稿人

荣誉获奖

1. 2023年荣获教育部高等学校科学研究优秀成果2等奖(第5完成人)

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